Các HTX hiện có nhiều nông sản là đặc sản, đạt chất lượng để xuất khẩu nhưng còn khó khăn về ứng dụng công nghệ vào khâu bảo quản, vận chuyển, đóng gói. Ngoài ra, một số HTX ứng dụng công nghệ vào sản xuất nhưng qua thời gian cho thấy vẫn chưa phù hợp với thực tiễn nên giá trị kinh tế mang về chưa cao, việc kiểm soát dịch bệnh còn khó khăn.
Để nâng cao giá trị gia tăng cho sản phẩm nông nghiệp, tỉnh Ninh Thuận đang tập trung đẩy mạnh liên kết sản xuất gắn với chế biến và mở rộng thị trường tiêu thụ. Đây là định hướng chiến lược nhằm phát triển nền nông nghiệp bền vững, hiệu quả, góp phần nâng cao thu nhập cho người dân và thúc đẩy phát triển kinh tế - xã hội địa phương.