Trước hành vi tự ý tích nước trước bão số 13, Chủ tịch UBND tỉnh Thừa Thiên - Huế giao Sở Công Thương rà soát, đánh giá lại thủ tục cấp phép hoạt động của thủy điện Thượng Nhật.
Ngày 16/11/2020, Cục Điện lực và Năng lượng tái tạo (Bộ Công Thương) tiếp tục có văn bản yêu cầu sở Công Thương Thừa Thiên Huế rà soát, báo cáo tình hình quản lý đầu tư xây dựng và vận hành các công trình thủy điện trên địa bàn tỉnh sau mưa lũ. Trước đó, ngày 14/11, Cục cũng đã có văn bản yêu cầu Nhà máy thủy điện Thượng Nhật dừng ngay việc tích nước theo chỉ đạo của UBND tỉnh Thừa Thiên Huế, đồng thời chỉ đạo các đơn vị liên quan có biện pháp xử lý nghiêm thủy điện này.
Trước thông tin Thủy điện Thượng Nhật tiếp tục tích nước trái phép, không chấp hành công điện khẩn chống bão số 13 của UBND tỉnh Thừa Thiên Huế, lãnh đạo tỉnh này đã xử lý kịp thời, kiên quyết, thể hiện trách nhiệm của địa phương đồng hành với Bộ Công Thương trong công tác phối hợp điều hành thủy điện.
Trước diễn biến phức tạp của bão số 13, Hà Tĩnh cấm biển từ 17 giờ ngày 13/11; Quảng Trị di dời dân trước 15 giờ ngày 14/11 còn Nghệ An lên kế hoạch đảm bảo an toàn các hồ đập thủy lợi, thủy điện.