Hệ thống quản lý chất lượng của cơ quan Bộ Công Thương được xây dựng phù hợp với tiêu chuẩn TCVN ISO 9001:2015. Trong đó có 64 thủ tục hành chính đã được Bộ Công Thương áp chuẩn ISO.
Từ ngày 10-13/11/2020, Đoàn công tác của Bộ Khoa học và Công nghệ do Thứ trưởng Lê Xuân Định làm Trưởng Đoàn đã đến làm việc về tình hình triển khai áp dụng Hệ thống quản lý chất lượng ISO 9001:2008 tại Bộ Công Thương.