Phù Yên là một trong những địa phương có nhiều lợi thế để phát triển nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao. Nhằm khai thác hiệu quả tiềm năng, huyện đã quy hoạch 4 tiểu vùng phát triển kinh tế, trong đó, tiểu vùng II là vùng trọng điểm lúa, gồm 9 xã (Huy Hạ, Huy Bắc, Huy Tường, Huy Thượng, Huy Tân, Quang Huy, Tường Phù, Gia Phù, Tường Thượng), tổng diện tích 1.300 ha nằm trên cánh đồng Mường Tấc, với nguồn nước dồi dào từ suối Tấc được cung cấp bởi hồ Suối Chiếu xã Mường Thải.
Từ nguồn vốn tín dụng nông nghiệp, nông thôn, nhiều hộ dân trên địa bàn huyện Phù Yên đã mạnh dạn đầu tư phát triển sản xuất, kinh doanh hiệu quả, tạo thêm nhiều việc làm và thu nhập ổn định cho người dân địa phương.