Trên toàn tuyến kênh chính Tân Mỹ có nhiều các hộ dân đã lấn chiếm và tái lấn chiếm vào phạm vi hành lang bảo vệ công trình với rất nhiều hình thức như: xây nhà, dựng hàng rào, tập kết vật liệu...