Thực trạng nguồn nước sông Đu chảy qua một số địa phận chuyển màu đen, bốc mùi hôi thối nồng nặc và xuất hiện tình trạng cá chết bất thường khiến cho người dân sống trong lo lắng bởi nguy cơ ô nhiễm dòng nước.
Cùng với sự phát triển kinh tế, nhất là việc xả thải sai quy định của nhiều khu công nghiệp, nhiều doanh nghiệp, trang trại chăn nuôi… đã dẫn đến tình trạng hàng loạt dòng sông, suối tại nhiều địa phương đã và đang bị bức tử.