Hiện tại, thị xã Hoàng Mai chưa có quy hoạch vùng nước cho nuôi hàu, tất cả các bè nuôi đều đang tập kết trên sông Hoàng Mai, ảnh hưởng đến việc lưu thông của tàu, thuyền và khả năng tiêu thoát lũ.