Cùng với làm tốt nhiệm vụ bảo vệ chủ quyền lãnh thổ, biên giới quốc gia, lực lượng Bộ đội Biên phòng Sơn La còn tích cực tham mưu cho cấp ủy, chính quyền địa phương các xã biên giới củng cố hệ thống chính trị, nâng cao năng lực lãnh đạo, hiệu lực, hiệu quả hoạt động của cấp ủy, chính quyền các cấp trên địa bàn khu vực biên giới của tỉnh.