Dù đã có nhiều quy định để quản lý, giám sát xe hợp đồng trá hình. Song sự liên thông giữa các cơ quan chức năng còn lỏng lẻo khiến loại xe này vẫn ngang nhiên hoạt động.
Trước đây, việc sắp xếp, phân luồng các bến xe nhằm hạn chế ùn tắc, nhưng sự nở rộ của xe hợp đồng trá hình đã khiến kế hoạch không những đứng trước nguy cơ đổ vỡ, mà còn thất thu thuế.
Theo quy định, trước khi vận chuyển khách 'xe hợp đồng' phải được đàm phán và ký kết hợp đồng theo nhóm khách hàng, khi thực hiện vận chuyển chỉ chạy từ điểm A đến điểm B cố định. Tuy nhiên, hiện nhiều xe khách loại từ 29 chỗ trở lên hoặc giường nằm có đeo phù hiệu 'xe hợp đồng' tại Hà Nội vừa dừng đỗ bắt, trả khách tại nhiều điểm trên đường vừa chạy xuyên tâm và thu tiền theo khách lẻ.