Tại Huệ Nghiêm hiện nay, trên pháp lý được tổ chức với hình thức tự viện, tuy nhiên, về nội dung, chúng tôi cố gắng gìn giữ nề nếp của một Phật học viện với sự sinh hoạt, học tập đặc thù.
Phật học viện Huệ Nghiêm là ngôi trường do chư tổ Ấn Quang và các tổ sư Phật học đường Nam Việt dày công gầy dựng, là ngôi trường kế thừa hậu duệ của Phật học đường Nam Việt.