Theo Sở Nông nghiệp và Môi trường An Giang, vào mùa khô hàng năm, mực nước nội đồng xuống thấp, nguy cơ cao nước mặn xâm nhập vùng tứ giác Long Xuyên, các khu vực lân cận và vùng ven biển trên địa bàn tỉnh.
Song song với phát triển sản xuất, kinh doanh, các chủ đầu tư hạ tầng khu công nghiệp chú trọng đầu tư, vận hành hiệu quả hệ thống xử lý nước thải tập trung, bảo đảm nước thải được xử lý đạt quy chuẩn trước khi xả ra môi trường. Nhờ đó, nhiều năm qua, trên địa bàn tỉnh Bắc Ninh không xảy ra sự cố ô nhiễm nghiêm trọng tại các khu công nghiệp, góp phần thúc đẩy phát triển công nghiệp theo hướng xanh, bền vững.
Việc vận hành các cống kiểm soát mặn, giữ ngọt dài ngày đã khiến nước ngưng lưu thông, dẫn đến tích tụ ô nhiễm và mùi hôi, ảnh hưởng đến đời sống và sinh hoạt của người dân sống xung quanh các kênh nội ô phường Rạch Giá (tỉnh An Giang).