Theo nhiều tư liệu và lời kể của cư dân địa phương, Dinh Cậu được cho là đã xuất hiện từ khoảng thế kỷ XVII, gắn với thời kỳ người dân bắt đầu đến đảo sinh sống bằng nghề biển. Ngôi dinh hiện nay được xây dựng vào năm 1937 và trùng tu lại vào năm 1997, nhưng vẫn giữ được nét cổ kính đặc trưng giữa không gian biển đảo.