Men vi sinh (probiotics) ngày càng được sử dụng phổ biến khi đau bụng, tiêu chảy, táo bón hoặc trong thời gian dùng kháng sinh. Tuy nhiên, chuyên gia Bệnh viện Bạch Mai khuyến cáo không nên coi men vi sinh là "thuốc bổ đường ruột" để sử dụng tùy ý.
Probiotics có thể hỗ trợ giảm tác dụng không mong muốn khi điều trị H. pylori và cải thiện một số triệu chứng IBS, tùy chủng và người bệnh.