Thời gian qua, thương mại điện tử phát triển nhanh chóng, đặt ra những thách thức nhất định trong quản lý hải quan với lĩnh vực này, trong đó có việc thu thuế giá trị gia tăng (GTGT, VAT) đối với hàng nhập khẩu có giá trị nhỏ qua hoạt động thương mại điện tử.
Tổng cục Hải quan cho biết sẽ thảo luận với hải quan các nước thành viên tại Hội nghị Tổng cục trưởng Hải quan ASEAN lần thứ 33 về chính sách thuế với hàng hóa nhập khẩu qua thương mại điện tử, qua đó báo cáo Chính phủ để ban hành quy định phù hợp nhất.
Hiện Bộ Tài chính đang xây dựng dự thảo nghị định, qua đó đề xuất miễn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu giao dịch qua thương mại điện tử có trị giá hải quan theo từng đơn hàng từ 2 triệu đồng trở xuống, đồng thời phải nộp thuế VAT.
Theo Quy định hiện nay của Chính phủ, hàng nhập khẩu dưới 1 triệu đồng gửi qua dịch vụ chuyển phát nhanh trên sàn thương mại điện tử được miễn thuế nhập khẩu, thuế VAT đầu vào. Hiện nay, giá trị các mặt hàng nhập khẩu qua các sàn thương mại điện tử đã lên tới hàng tỉ USD mỗi tháng. Ủy ban Tài chính ngân sách của Quốc hội đã đề nghị nghiên cứu thu thuế VAT hàng hóa giá trị nhỏ qua thương mại điện tử để có thêm nguồn thu.