Cùng với đề xuất cán bộ quản lý, nhà khoa học, chuyên gia có thu nhập phát sinh tại Trung tâm tài chính quốc tế được miễn thuế thu nhập cá nhân mà đề xuất này đang nhận được sự phản hồi không nhất trí của Bộ Tài chính, Bộ Kế hoạch và Đầu tư còn có nhiều đề xuất chính sách tài chính và các chính sách khác liên quan đến hoạt động của Trung tâm tài chính quốc tế.
Bộ Tài chính cho rằng việc miễn thuế thu nhập cá nhân cho các lao động tại trung tâm tài chính là quá dàn trải và có thể làm tăng khoảng cách thu nhập giữa các ngành.
Góp ý chính sách với việc thành lập và hoạt động của trung tâm tài chính tại Việt Nam, đại diện Bộ Tài chính nhất trí phải có cơ chế ưu đãi vượt trội về thuế, phí, trong đó cần xác định mức ưu đãi theo định hướng của Đảng, nhà nước và phù hợp với quy định về thuế TNCN, TNDN.
Bộ Tài chính đề nghị bỏ nội dung đề xuất cơ chế ưu đãi về thuế thu nhập cá nhân tại dự thảo Nghị quyết về việc thành lập và hoạt động của trung tâm tài chính tại Việt Nam.
Trong khi Bộ Kế hoạch và Đầu tư (KH-ĐT) đề xuất miễn thuế thu nhập cá nhân ở trung tâm tài chính với mục tiêu tăng tính cạnh tranh quốc tế và thu hút nhân lực chất lượng cao, thì Bộ Tài chính lại bác đề xuất này vì tính công bằng xã hội và sự đồng bộ trong hệ thống pháp luật.
Bộ Tài chính kiến nghị loại bỏ đề xuất ưu đãi thuế thu nhập cá nhân trong dự thảo Nghị quyết về việc thành lập và vận hành trung tâm tài chính tại Việt Nam.