Ngoài Sơn Đoòng, Thiên Đường, Tiên Sơn..., Vườn quốc gia Phong Nha-Kẻ Bàng còn sở hữu hang Én, hang Pygmy, hang Tối, thác Gió – vườn thực vật, suối Nước Moọc... Các 'kho báu' này cho đến nay vẫn còn nhiều điều chưa khám phá hết.
Được ví như một bảo tàng địa chất khổng lồ, VQG Phong Nha-Kẻ Bàng sở hữu hàng loạt địa điểm độc, lạ và bí ẩn như động Thiên Đường, Tiên Sơn… Trong năm 2020, các nhà khoa học phát hiện thêm các hang động mới.