Trên địa bàn huyện Yên Châu có quốc lộ 6, quốc lộ 6C, tỉnh lộ 103 đi qua và các tuyến đường nội huyện, với lượng phương tiện lưu thông tương đối nhiều. Lực lượng cảnh sát giao thông, Công an huyện đã triển khai đồng bộ các biện pháp, đảm bảo trật tự an toàn giao thông.