Ngoài nợ bảo hiểm, trường này cũng bị cấm tuyển sinh năm học mới do không đạt chỉ tiêu tuyển sinh trong năm học trước.
Sở Giáo dục và đào tạo đã công khai thông báo số 3888 về kết quả kiểm tra công tác quản lý và thực hiện một số hoạt động giáo dục tại các cơ sở giáo dục tư thục trên địa bàn tỉnh, trong đó có Trường TH-THCS-THPT Lê Quý Đôn (xã Phú Lâm, huyện Tân Phú).