Sau sắp xếp đơn vị hành chính, Cần Thơ đứng trước yêu cầu mới trong việc củng cố, nâng cao chất lượng y tế cơ sở. Với mạng lưới trạm y tế xã, phường từng bước chuẩn hóa từ hạ tầng, nhân lực đến trang, thiết bị…, thành phố hướng tới xây dựng hệ thống y tế cơ sở toàn diện, hiện đại, phục vụ người dân thuận tiện, hiệu quả hơn.
Với mục tiêu nâng cao năng lực 'phòng bệnh hơn chữa bệnh', các cơ sở y tế TPHCM đang được đầu tư cơ sở vật chất, tăng cường nguồn nhân lực đủ về số lượng, mạnh về chuyên môn, làm chủ công nghệ. Tuy nhiên, thực tế vẫn còn một số bất cập về nguồn nhân lực, chế độ đãi ngộ, cơ sở vật chất cần được tháo gỡ.