Bộ Y tế luôn ủng hộ việc mở rộng hợp tác y tế giữa Việt Nam và Nhật Bản theo hướng toàn diện, gắn chặt với các ưu tiên, đặc biệt trong các lĩnh vực: hồi sức cấp cứu, an ninh y tế, đào tạo nhân lực, nghiên cứu khoa học và ứng phó với các tình huống y tế khẩn cấp...
Trong hơn 50 năm thiết lập quan hệ ngoại giao giữa Việt Nam và Nhật Bản, hợp tác y tế ngày càng được củng cố và phát triển sâu rộng, trở thành một trong những trụ cột quan trọng của quan hệ đối tác chiến lược toàn diện giữa hai nước.